داستان این نسخه مدتی پس از اتمام قسمت دوم شروع می شود. آمریکا در حال دفاع در برابر یک حمله غافلگیرانه از طرف روسیه است و احتمالا هم در منهتن نیویورک خواهد بود. اما این تنها نقش بازی کننده در بازی نخواهد بود و جنگاوری نوین 3 همانند یک تور مسافرتی به اقصی نقاط جهان خواهد بود. بعضی از موقعیت هایی که بازیکنان در میان یک درگیری قرار خواهند گرفت عبارتند از : آمریکا - روسیه - هند - سیرالئون - سومالی - انگلستان - آلمان - فرانسه - جمهوری چک - امارات متحده العربی و ... . شخصیت هایی از قسمت های قبلی در ندای وظیفه 3 نیز حاضر خواهند بود و داستان این افراد در قسمت سوم ندای وظیفه کامل خواهد شد. دو شخصیت جدید از نیروی دلتا به نامهای " frost " و " sandman " نیز به بازی ملحق خواهند شد. در طول 15 ماموریت بازی، نقش های مختلفی از یک سرباز ساده تا یک مامور جسوسی فوق سری روسیه را به عهده خواهید گرفت و البته نقش دوست داشتنی توپچی هواپیمای   (AC-130 (spectre gunship نیز در این نسخه وجود خواهد داشت. البته از داستان بازی هم جزئیاتی در اینترنت درز کرده است اما در حال حاضر قابل استناد نیست. Robert Bowling یکی از افراد در شرکت اینفینیتی وارد،  در پاسخ به به یکی از سایت های خبری گفته است که : بخش هایی از این اطلاعات درست است اما در بازی نهایی ممکن است قسمت هایی متفاوت از آنچه تا به حال شنیده اید باشد.

همانطور که می دانید بازی جنگاوری نوین 3 روز هشتم نوامبر منتشر خواهد شد و به احتمال 99% اطلاعات منتشره در سایت های خبری درست خواهد بود!